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親緣關系鑒定

在動物育種過程中,由于人工授精操作不規范、系譜文件缺失、引種記錄不全等因素,很多育種企業都面臨著群體結構混亂和系譜不完善等問題,這大大影響了企業正常的生產和育種工作。一份準確的系譜信息,對于確保育種群體中優秀原種的真實身份,提高育種值的估計的準確性,實現科學引種、選配和培育優良品種,加快育種遺傳進展具有十分重要的意義。通過系統進化樹、親緣關系矩陣和計算PI_HAT值等方法互相驗證,對同一品種不同個體的基因分型數據進行親緣關系分析。

Sample requirements

材料準備            

  •                            

    DNA樣品

     總量:

    ≥ 1.0μg

     濃度:

    ≥ 50ng/μL

  •                            

    組織樣本

     總量:

    ≥ 100mg(動物),

    ≥ 200mg(植物)

  •                            

    血液樣本

     總量:

    ≥ 2mL

Schematic diagram and flow chart

技術示意圖及具體流程                

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Credit analysis

結果展示            

  • 系統進化樹分析 /                            
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    描述群體內個體間進化順序的分支圖或樹,用來表示群體間的進化關系。根據群體的物理或遺傳學特征等方面的共同點或差異計算其親緣關系遠近。
  • 親緣關系矩陣 /                            
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    根據全基因組等位基因頻率構建親緣關系矩陣( Kinshipmatrix);然后,計算親緣關系矩陣的特征值和特征向量。
  • PI_HAT估算 /    
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    計算親本與子代之間的PI_HAT值,完全不相關的兩個個體,其PI-HAT值=0;具親子關系的樣本,其PI-HAT接近0.5;而重復樣本,其PI-HAT值=1。
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