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植物全基因組分型芯片 ——高通量、精準、性價比高                

單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism, SNP) 是指基因組單個核苷酸的變異,其數量眾多、分布密集、易于檢測,使得利用SNP分型芯片來進行品種的改良已經成為現代農業研究的一個常用方法。通過植物SNP 分型芯片,檢測位點由傳統的幾十對基因提高到現在的幾千甚至幾萬個位點,檢測的準確度和通量也隨之成倍地增加。

Plant genome SNP genotyping array

植物全基因組SNP分型芯片

Technological process

技術流程

Sample requirements

樣本要求

  • ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

    DNA樣品

    ?總量:

    ≥ 1.0μg

    ?濃度:

    ≥ 50ng/μL

  • ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

    組織樣本

    ?總量:

    ≥ 200mg

  • ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

    細胞樣本

    ?總量:

    ≥ 1X107

Bioinformatics Analysis

生信分析

  • 基本分析 /Basic analysis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
    ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
    芯片質控分析
    樣本質控分析
    SNP分型結果
    SNP Plink格式的分型結果
  • 高級分析 /Advanced analysis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
    ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
    選擇信號分析
    時間序列分析
    親緣關系鑒定
    進化分析
    品種鑒定
    Haploview分析
    CNV分析
    全基因組關聯分析
  • 個性化分析 /Personalized analysis ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
    ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
    兩個樣本之間SNP分型差異位點統計
    兩個樣本之間相同SNP分型位點統計
    比較組間交集SNP
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