玉米遺傳育種產業服務

玉米不僅是我國重要的糧食作物,也是重要的工業原料和生物能源。通過玉米育種芯片,如kps玉米6H90K芯片等,可以快速進行玉米DNA指紋鑒定、基因定位、群體進化分析及種質資源鑒定等,為玉米育種產業服務奠定基礎。

玉米分子育種平臺

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Technological process

技術流程    


  •            

    step 1        


           


  •            

    step 1        


           


  •            

    step 2        


           


  •            

    step 3       


           

  • Illumina?平臺原理與實驗流程

    對基因組DNA進行定量;

    非PCR擴增;

    片段化gDNA、沉淀與重懸浮;

    雜交:DNA片段變性后,與芯片上特異的50 mer寡核苷酸探針形成退火,一種微珠類型對應一個SNP位點;

    延伸與染色:洗去未雜交和非特異雜交的DNA之后,在芯片上進行單堿基延伸,單堿基添加了特異的熒光基團,從而可區分樣本的SNP基因型。

  • AxiomTM平臺原理與實驗流程

    DNA定量后進行DNA擴增;

    片段化gDNA、沉淀與重懸;

    變性與雜交:DNA片段變性后與芯片上的特異的30 mer寡核苷酸探針形成退火,一種類型對應一個SNP位點;

    延伸、連接與染色:洗去未雜交和非特異性雜交的DNA之后,帶有特定熒光基團的檢測探針與正確堿基配對后連接,從而區分SNP的基因型。

Sample requirements

樣本要求    

  •                    

    DNA樣品

     總量:

    ≥ 1.0μg

     濃度:

    ≥ 50ng/μL

  •                    

    組織樣本

     總量:

    ≥ 100mg

  •                    

    血液樣本

     總量:

    ≥ 2mL

Credit analysis

生信分析

  • 基本分析 /Basic analysis
    芯片質控分析
    樣本質控分析
    SNP分型結果
    SNP Plink格式的分型結果
  • 高級分析 /Advanced analysis
    選擇信號分析
    時間序列分析
    親緣關系鑒定
    進化分析
    品種鑒定
    Haploview分析
    CNV分析
    全基因組關聯分析
  • 個性化分析 /Personalized analysis
    兩個樣本之間SNP分型差異位點統計
    兩個樣本之間相同SNP分型位點統計
    比較組間交集SNP
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